Cục trưởng

• Trung tướng, Giáo sư, Tiến sĩ Nguyễn Ngọc Anh, từ 9.2014–7.2020[8]
• Đại tá Vũ Huy Khánh, từ 7.2020–12.2020 (Phó Cục trưởng phụ trách)[9]
• Thiếu tướng, Phó Giáo sư, Tiến sĩ Phạm Công Nguyên từ 12.2020–3.2021[10] và từ 7.2021–nay[11]
• Thiếu tướng Tô Văn Huệ, từ 3.2021–7.2021[11]

Phó Cục trưởng

• Đại tá Nguyễn Xuân Toản, từ 12.2014–10.2019

• Đại tá Trần Thế Quân, từ 5.2015–2.2017

• Đại tá Nguyễn Thị Xuân, từ 11.2019–4.2020

• Đại tá Vũ Ngọc Hùng, từ 10.2019–nay